轻井泽是许多物种的家园，包括树木、野花、鸟类和动物。
轻井泽位于海拔950米至1200米的高原上，比关东地区和其他平地晚一个月迎来春天。在笼罩在薄雾中的短暂夏季过后，秋叶在9月开始转动，11月落下，让森林枯萎，进入冬季和连续的零度以下的冬季。全年的温度变化很大，但也有每天的温度变化。这种多变的气候孕育了许多生物的生命。
从整个城镇来看，有各种各样的环境，从浅山的高山植被到山脚下的柞树森林和南晴泽的湿地。众多的植物和动物在这些环境中栖息。
虽然有许多植物物种和鸟类物种，但凉爽的气候意味着爬行动物和昆虫物种相对有限。
许多珍稀物种也生活在这里，在长野县红色数据手册中列出的濒危物种中（濒危一级和濒危二级），在轻井泽发现了57种维管植物和39种动物。长仓的Hanahyotanboku群落也被列为高度罕见的植物群落。
