轻井泽是多种树木、野花、鸟类和动物的家园。
轻井泽位于海拔 950 米至 1200 米的高原上，春天的到来要比关东和其他平地晚一个月左右。经过薄雾笼罩的短暂夏季后，秋叶在 9 月开始变色，到 11 月树叶脱落，森林再次成为冬日的死地，随后便是持续的零度以下的冬季。全年气温变化很大，但每天的气温也有变化。这种多变的气候孕育了许多生物的生命。
从浅间山的高山植物到山脚下的柞树林和南軽沢的湿地，整个城市的环境千姿百态。在这些环境中栖息着众多动植物。
虽然植物和鸟类种类繁多，但由于气候凉爽，爬行动物和昆虫的种类相对有限。
这里还生活着许多珍稀物种，在《长野县红色数据手册》（濒危 I 级和濒危 II 级物种）中列出的濒危物种中，轻井泽发现了 57 种维管束植物和 39 种动物。长仓的花叶田北群落也被列为高度稀有植物群落。
